Администратор FossDoc — пользователь Системы, который отвечает за ее работу, настройку, ввод в Систему новых пользователей, введения новых записей в справочник подразделений, назначения прав доступа, и т.п. Для того чтобы определенный пользователь мог выполнять функции администратора Системы, его необходимо ввести в группу пользователей «Администраторы». Администрирование Системы выполняется с помощью программы Smart Client.